Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc27Q3V036 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc27Q3V036 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc27Q3V036 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc27Q3V036 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc27Q3V036 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc27Q3V036 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc27Q3V036 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc27Q3V036 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc27Q3V036 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc27Q3V036 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc27Q3V036 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc27Q3V036 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc27Q3V036 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc27Q3V036 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc27Q3V036 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc27Q3V036 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc27Q3V036 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc27Q3V036 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc27Q3V036 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc27Q3V036 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc27Q3V036 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc27Q3V036 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc27Q3V036 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc27Q3V036 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc27Q3V036 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc27Q3V036 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc27Q3V036 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc27Q3V036 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc27Q3V036 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc27Q3V036 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc27Q3V036 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc27Q3V036 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc27Q3V036 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc27Q3V036 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc27Q3V036 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc27Q3V036 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc27Q3V036 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc27Q3V036 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc27Q3V036 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc27Q3V036 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc27Q3V036 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc27Q3V036 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc27Q3V036 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc27Q3V036 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc27Q3V036 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc27Q3V036 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc27Q3V036 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc27Q3V036 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc27Q3V036 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc27Q3V036 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc27Q3V036 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc27Q3V036 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc27Q3V036 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc27Q3V036 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc27Q3V036 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc27Q3V036 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc27Q3V036 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc27Q3V036 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc27Q3V036 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc27Q3V036 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc27Q3V036 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc27Q3V036 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc27Q3V036 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc27Q3V036 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc27Q3V036 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc27Q3V036 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc27Q3V036 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc27Q3V036 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc27Q3V036 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc27Q3V036 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc27Q3V036 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc27Q3V036 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc27Q3V036 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc27Q3V036 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc27Q3V036 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc27Q3V036 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc27Q3V036 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc27Q3V036 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc27Q3V036 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc27Q3V036 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc27Q3V036 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc27Q3V036 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc27Q3V036 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc27Q3V036 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc27Q3V036 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc27Q3V036 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc27Q3V036 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc27Q3V036 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc27Q3V036 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc27Q3V036 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc27Q3V036 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc27Q3V036 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc27Q3V036 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc27Q3V036 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc27Q3V036 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc27Q3V036 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc27Q3V036 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc27Q3V036 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc27Q3V036 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.1 ms