Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ39

Lrrfip1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrfip1Q3UZ39 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms