Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXB0

Mbd3l2, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3l2Q3UXB0 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mbd3l2Q3UXB0 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mbd3l2Q3UXB0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mbd3l2Q3UXB0 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mbd3l2Q3UXB0 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mbd3l2Q3UXB0 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Mbd3l2Q3UXB0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mbd3l2Q3UXB0 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mbd3l2Q3UXB0 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Mbd3l2Q3UXB0 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Mbd3l2Q3UXB0 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Mbd3l2Q3UXB0 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Mbd3l2Q3UXB0 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Mbd3l2Q3UXB0 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Mbd3l2Q3UXB0 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Mbd3l2Q3UXB0 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Mbd3l2Q3UXB0 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Mbd3l2Q3UXB0 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Mbd3l2Q3UXB0 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Mbd3l2Q3UXB0 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mbd3l2Q3UXB0 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mbd3l2Q3UXB0 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mbd3l2Q3UXB0 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mbd3l2Q3UXB0 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mbd3l2Q3UXB0 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mbd3l2Q3UXB0 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mbd3l2Q3UXB0 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mbd3l2Q3UXB0 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Mbd3l2Q3UXB0 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms