Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ97

Gm5460, Predicted gene 5460, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5460Q3UQ97 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5460Q3UQ97 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5460Q3UQ97 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5460Q3UQ97 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5460Q3UQ97 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5460Q3UQ97 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5460Q3UQ97 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5460Q3UQ97 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5460Q3UQ97 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5460Q3UQ97 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5460Q3UQ97 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5460Q3UQ97 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5460Q3UQ97 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5460Q3UQ97 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5460Q3UQ97 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5460Q3UQ97 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5460Q3UQ97 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5460Q3UQ97 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5460Q3UQ97 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5460Q3UQ97 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5460Q3UQ97 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5460Q3UQ97 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5460Q3UQ97 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5460Q3UQ97 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5460Q3UQ97 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5460Q3UQ97 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Gm5460Q3UQ97 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5460Q3UQ97 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5460Q3UQ97 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5460Q3UQ97 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Gm5460Q3UQ97 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Gm5460Q3UQ97 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Gm5460Q3UQ97 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Gm5460Q3UQ97 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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