Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms