Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms