Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms