Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CrxosQ3UL53 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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