Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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