Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms