Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Hormad1-204ENSMUST00000171191 1437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19210-201ENSMUST00000199562 1350 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24241-201ENSMUST00000157787 145 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3760-201ENSMUST00000167475 804 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3047-202ENSMUST00000177998 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8297-203ENSMUST00000178389 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3460-202ENSMUST00000178927 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21103-203ENSMUST00000179042 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8159-203ENSMUST00000179231 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3029-202ENSMUST00000179327 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 4930557J02Rik-201ENSMUST00000202325 1075 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Scgb2b24-201ENSMUST00000055444 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1061-201ENSMUST00000099889 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12507-201ENSMUST00000119155 415 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11835-201ENSMUST00000120635 663 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
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Gtpbp6Q3U6U5 Pip-202ENSMUST00000203244 736 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp942-201ENSMUST00000074295 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms