Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnf40Q3U319 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf40Q3U319 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rnf40Q3U319 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Rnf40Q3U319 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf40Q3U319 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf40Q3U319 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Rnf40Q3U319 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf40Q3U319 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf40Q3U319 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf40Q3U319 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf40Q3U319 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf40Q3U319 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf40Q3U319 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf40Q3U319 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf40Q3U319 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf40Q3U319 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf40Q3U319 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf40Q3U319 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf40Q3U319 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf40Q3U319 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf40Q3U319 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf40Q3U319 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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