Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.4 ms