Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc102aQ3TMW1 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms