Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smarca4Q3TKT4 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms