Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cers3Q1A3B0 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms