Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms