Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms