Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms