Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
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Ttc21bQ0HA38 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
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Ttc21bQ0HA38 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
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Ttc21bQ0HA38 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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Ttc21bQ0HA38 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
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Ttc21bQ0HA38 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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Ttc21bQ0HA38 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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Ttc21bQ0HA38 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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