Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pate4Q09098 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pate4Q09098 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pate4Q09098 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pate4Q09098 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pate4Q09098 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pate4Q09098 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pate4Q09098 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pate4Q09098 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pate4Q09098 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pate4Q09098 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pate4Q09098 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pate4Q09098 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pate4Q09098 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pate4Q09098 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pate4Q09098 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pate4Q09098 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pate4Q09098 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pate4Q09098 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pate4Q09098 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pate4Q09098 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pate4Q09098 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pate4Q09098 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pate4Q09098 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pate4Q09098 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pate4Q09098 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Pate4Q09098 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pate4Q09098 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pate4Q09098 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pate4Q09098 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pate4Q09098 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pate4Q09098 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pate4Q09098 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pate4Q09098 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pate4Q09098 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pate4Q09098 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pate4Q09098 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pate4Q09098 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pate4Q09098 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pate4Q09098 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pate4Q09098 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pate4Q09098 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pate4Q09098 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pate4Q09098 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pate4Q09098 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pate4Q09098 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pate4Q09098 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pate4Q09098 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pate4Q09098 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pate4Q09098 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pate4Q09098 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pate4Q09098 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pate4Q09098 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pate4Q09098 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pate4Q09098 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Pate4Q09098 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pate4Q09098 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pate4Q09098 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pate4Q09098 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Pate4Q09098 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Pate4Q09098 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Pate4Q09098 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pate4Q09098 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pate4Q09098 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pate4Q09098 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pate4Q09098 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pate4Q09098 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pate4Q09098 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pate4Q09098 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pate4Q09098 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pate4Q09098 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pate4Q09098 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pate4Q09098 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pate4Q09098 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pate4Q09098 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pate4Q09098 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pate4Q09098 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pate4Q09098 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pate4Q09098 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pate4Q09098 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pate4Q09098 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pate4Q09098 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pate4Q09098 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pate4Q09098 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pate4Q09098 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pate4Q09098 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pate4Q09098 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pate4Q09098 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pate4Q09098 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pate4Q09098 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pate4Q09098 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pate4Q09098 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pate4Q09098 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pate4Q09098 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pate4Q09098 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pate4Q09098 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pate4Q09098 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pate4Q09098 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pate4Q09098 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pate4Q09098 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms