Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms