Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms