Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms