Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms