Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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