Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms