Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms