Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms