Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Cacna1sQ02789 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cacna1sQ02789 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cacna1sQ02789 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cacna1sQ02789 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cacna1sQ02789 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Cacna1sQ02789 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cacna1sQ02789 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cacna1sQ02789 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cacna1sQ02789 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cacna1sQ02789 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cacna1sQ02789 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cacna1sQ02789 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cacna1sQ02789 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacna1sQ02789 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacna1sQ02789 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacna1sQ02789 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacna1sQ02789 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacna1sQ02789 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacna1sQ02789 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacna1sQ02789 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacna1sQ02789 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacna1sQ02789 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacna1sQ02789 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacna1sQ02789 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacna1sQ02789 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacna1sQ02789 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacna1sQ02789 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacna1sQ02789 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacna1sQ02789 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacna1sQ02789 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacna1sQ02789 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacna1sQ02789 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacna1sQ02789 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna1sQ02789 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna1sQ02789 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna1sQ02789 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna1sQ02789 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna1sQ02789 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna1sQ02789 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna1sQ02789 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna1sQ02789 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna1sQ02789 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna1sQ02789 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna1sQ02789 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna1sQ02789 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna1sQ02789 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna1sQ02789 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna1sQ02789 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna1sQ02789 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna1sQ02789 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna1sQ02789 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna1sQ02789 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna1sQ02789 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna1sQ02789 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna1sQ02789 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna1sQ02789 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna1sQ02789 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna1sQ02789 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna1sQ02789 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna1sQ02789 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna1sQ02789 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna1sQ02789 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna1sQ02789 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna1sQ02789 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna1sQ02789 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna1sQ02789 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacna1sQ02789 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacna1sQ02789 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacna1sQ02789 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacna1sQ02789 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms