Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms