Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Snai1Q02085 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snai1Q02085 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snai1Q02085 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snai1Q02085 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snai1Q02085 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snai1Q02085 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snai1Q02085 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snai1Q02085 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snai1Q02085 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snai1Q02085 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snai1Q02085 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snai1Q02085 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snai1Q02085 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snai1Q02085 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snai1Q02085 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snai1Q02085 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snai1Q02085 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Snai1Q02085 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Snai1Q02085 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snai1Q02085 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snai1Q02085 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snai1Q02085 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snai1Q02085 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Snai1Q02085 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snai1Q02085 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snai1Q02085 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snai1Q02085 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snai1Q02085 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snai1Q02085 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snai1Q02085 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snai1Q02085 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snai1Q02085 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snai1Q02085 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Snai1Q02085 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snai1Q02085 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snai1Q02085 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snai1Q02085 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snai1Q02085 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snai1Q02085 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snai1Q02085 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snai1Q02085 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snai1Q02085 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snai1Q02085 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snai1Q02085 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snai1Q02085 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snai1Q02085 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snai1Q02085 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Snai1Q02085 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Snai1Q02085 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snai1Q02085 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snai1Q02085 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snai1Q02085 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snai1Q02085 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snai1Q02085 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snai1Q02085 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snai1Q02085 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snai1Q02085 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snai1Q02085 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snai1Q02085 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snai1Q02085 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snai1Q02085 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snai1Q02085 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Snai1Q02085 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Snai1Q02085 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Snai1Q02085 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snai1Q02085 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snai1Q02085 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snai1Q02085 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snai1Q02085 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snai1Q02085 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snai1Q02085 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snai1Q02085 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snai1Q02085 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Snai1Q02085 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snai1Q02085 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snai1Q02085 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snai1Q02085 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snai1Q02085 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snai1Q02085 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snai1Q02085 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snai1Q02085 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snai1Q02085 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snai1Q02085 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snai1Q02085 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snai1Q02085 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snai1Q02085 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snai1Q02085 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snai1Q02085 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snai1Q02085 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snai1Q02085 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snai1Q02085 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snai1Q02085 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snai1Q02085 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snai1Q02085 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snai1Q02085 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snai1Q02085 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snai1Q02085 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snai1Q02085 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snai1Q02085 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms