Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms