Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms