Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms