Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Pde1bQ01065 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Pde1bQ01065 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Pde1bQ01065 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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