Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SeleQ00690 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SeleQ00690 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
SeleQ00690 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms