Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms