Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms