Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lig3P97386 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lig3P97386 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lig3P97386 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lig3P97386 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig3P97386 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig3P97386 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lig3P97386 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms