Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Psme1P97371 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Psme1P97371 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Psme1P97371 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Psme1P97371 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psme1P97371 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Psme1P97371 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Psme1P97371 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Psme1P97371 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Psme1P97371 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Psme1P97371 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Psme1P97371 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms