Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms