Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

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Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Gabpb2P81069 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Gabpb2P81069 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Gabpb2P81069 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Gabpb2P81069 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms