Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Otx1P80205 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Otx1P80205 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Otx1P80205 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Otx1P80205 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms