Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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