Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms