Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NficP70255 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NficP70255 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NficP70255 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NficP70255 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NficP70255 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NficP70255 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NficP70255 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
NficP70255 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NficP70255 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NficP70255 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
NficP70255 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
NficP70255 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NficP70255 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NficP70255 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NficP70255 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NficP70255 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NficP70255 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NficP70255 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NficP70255 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NficP70255 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NficP70255 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NficP70255 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NficP70255 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NficP70255 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NficP70255 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NficP70255 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NficP70255 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NficP70255 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NficP70255 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NficP70255 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NficP70255 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NficP70255 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NficP70255 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NficP70255 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NficP70255 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NficP70255 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NficP70255 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NficP70255 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NficP70255 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NficP70255 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NficP70255 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NficP70255 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NficP70255 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NficP70255 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NficP70255 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NficP70255 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NficP70255 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NficP70255 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NficP70255 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
NficP70255 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NficP70255 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NficP70255 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NficP70255 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NficP70255 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NficP70255 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NficP70255 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
NficP70255 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NficP70255 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NficP70255 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NficP70255 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NficP70255 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NficP70255 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NficP70255 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NficP70255 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
NficP70255 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NficP70255 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NficP70255 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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NficP70255 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
NficP70255 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NficP70255 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
NficP70255 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
NficP70255 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NficP70255 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NficP70255 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
NficP70255 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NficP70255 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NficP70255 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NficP70255 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NficP70255 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NficP70255 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NficP70255 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NficP70255 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NficP70255 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NficP70255 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NficP70255 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NficP70255 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NficP70255 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NficP70255 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NficP70255 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NficP70255 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
NficP70255 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NficP70255 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NficP70255 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NficP70255 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NficP70255 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NficP70255 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NficP70255 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NficP70255 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms