Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp46P62069 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp46P62069 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Usp46P62069 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Usp46P62069 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Usp46P62069 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Usp46P62069 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Usp46P62069 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Usp46P62069 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Usp46P62069 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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