Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms