Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga11P61622 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga11P61622 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga11P61622 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga11P61622 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga11P61622 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga11P61622 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga11P61622 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga11P61622 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga11P61622 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga11P61622 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga11P61622 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga11P61622 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga11P61622 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga11P61622 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga11P61622 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga11P61622 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga11P61622 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga11P61622 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga11P61622 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga11P61622 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga11P61622 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga11P61622 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga11P61622 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga11P61622 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga11P61622 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga11P61622 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga11P61622 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga11P61622 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga11P61622 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga11P61622 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga11P61622 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itga11P61622 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itga11P61622 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itga11P61622 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Itga11P61622 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itga11P61622 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itga11P61622 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itga11P61622 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itga11P61622 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itga11P61622 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itga11P61622 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itga11P61622 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itga11P61622 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itga11P61622 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itga11P61622 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Itga11P61622 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itga11P61622 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itga11P61622 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itga11P61622 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itga11P61622 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itga11P61622 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itga11P61622 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itga11P61622 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itga11P61622 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itga11P61622 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itga11P61622 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itga11P61622 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itga11P61622 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itga11P61622 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itga11P61622 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itga11P61622 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itga11P61622 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itga11P61622 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itga11P61622 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itga11P61622 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itga11P61622 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itga11P61622 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itga11P61622 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itga11P61622 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itga11P61622 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Itga11P61622 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Itga11P61622 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itga11P61622 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itga11P61622 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itga11P61622 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itga11P61622 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Itga11P61622 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itga11P61622 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itga11P61622 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itga11P61622 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itga11P61622 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itga11P61622 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itga11P61622 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itga11P61622 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Itga11P61622 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itga11P61622 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itga11P61622 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itga11P61622 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itga11P61622 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Itga11P61622 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Itga11P61622 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Itga11P61622 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Itga11P61622 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Itga11P61622 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Itga11P61622 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Itga11P61622 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Itga11P61622 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Itga11P61622 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Itga11P61622 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms